Fue creado en el 2008 como parte del Sistema de Unidades de Conservación de la ITAIPU Binacional. Debe su nombre al Río Karapā que atraviesa el refugio, y que en guaraní significa "curvo".

En sus bosques predominan el yvyra pytã (Peltophorum dubium), cedro (Cedrela fissilis), peterevy (Cordia trichotoma), kurupa'y (Anadenanthera colubrina), jacarati'a (Jacaratia spinosa) y guatambu (Balfourodendron riedelianum).

Se han clasificado:

• 43 especies de mamíferos, 259 especies de aves y 11 de reptiles.

Mamíferos como el lobo pé (Lontra longicaudis) y el carpincho (Hydrochoerus hydrochaeris), así como una gran diversidad de aves acuáticas pueden ser fácilmente observadas en los humedales que bordea el río.