Fue creada en 1984 como parte del Sistema de Unidades de Conservación de la ITAIPU Binacional. Debe su nombre al río Itabo que atraviesa la reserva, que junto con las nacientes y triburarios baña sus suelos dando origen a distintas comunidades vegetales entre ellas, las turberas y bosques ribereños.

Los bosques altos cubren su superficie predominando los grandes árboles de lapacho (Handroanthus heptaphylla), yvyra pytã (Peltophorum dubium), cedro (Cedrela fissilis), peterevy (Cordia trichotoma), guatambu (Balfourodendron riedelianum), entre otros. Se destaca la presencia de especies de plantas en peligro de extinción como los helechos arborescentes o chachi (Nephelea setosa) y el palmito (Euterpe edulis).

Se han clasificado:

• 45 especies de mamíferos, 310 especies de aves y 22 especies de reptiles

Siendo ITABO una de las reservas de mayor superficie en la zona, aún alberga especies importantes de grandes mamíferos como el puma y el tapir, una gran variedad de aves entre ellas el yryru ruvicha (Sarcoramphus papa) y las cinco especies de tucán registradas en el país.